农作物论文_水稻种子耐厌氧萌发全基因组关联-种子

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农作物论文_水稻种子耐厌氧萌发全基因组关联

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文章摘要:本研究目的是解析水稻芽期耐淹性的遗传基础，挖掘相关QTL，筛选优良单株，为分子标记辅助育种提供优异种质和理论支撑。本研究选取318份国内外水稻种质资源，在正常有氧和厌氧条件下测定种子萌发期的胚芽鞘长度，并计算相对胚芽鞘长度，通过整合基因型和表型数据进行全基因组关联分析。318份水稻种质间相对胚芽鞘长度差异明显，相对胚芽鞘长度的平均值为-0.238，中位置为-0.342，最低值-0.923，最高值为3.069。全基因组关联分析共鉴定到83个SNP显著与种子耐厌氧萌发性状相关。通过合并距离较近的SNP，共鉴定到27个耐厌氧萌发QTL，3个QTL与已报道的耐厌氧萌发QTL位置相近。其中qAG4-2与耐厌氧萌发性状的关联度较高，共有20个候选基因位于qAG4-2内，其中1个基因在厌氧条件下上调表达，2个基因下调表达。本研究挖掘的控制水稻耐厌氧萌发的QTL及优异种质资源将为水稻耐厌氧育种提供重要支撑。

文章关键词:水稻,厌氧萌发,全基因组关联分析,

项目基金:国家现代农业产业技术体系建设专项（CARS-01-14）,

论文作者:闵军^2,3 胡敏^2,3 张海清¹

作者单位:1. 湖南农业大学农学院 2. 湖南省农业科学院水稻研究所

论文DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20210425002

论文分类号: S511

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